Cet article a pour objet de proposer une double articulation pour l'analyse des systèmes théoriques en SHS qui permette une interaction facilitée avec l'informatique et les sciences de la nature, et qui donne des clefs épistémologiques pour étudier l'évolution de ces systèmes, leurs particularités et leurs adaptations possibles aux objets étudiés. Sans pouvoir être exhaustifs, nous tentons de proposer des ouvertures, en nous basant sur la logique et la géométrie de la connaissance, et en tenant compte de la spécificité des sciences humaines et sociales.